為維護民眾食用生鮮蔬果之安全，臺北農產公司自108年9月21日以來已採質譜化學快檢檢驗進場蔬果，20分鐘即可精確檢出農藥種類及濃度，該檢驗法經化學法複驗後準確率達99%，並搭配實名制在交易前可迅速比對供應代號及身分資料，落實從通路端追蹤產地耕種的農民，加強溯源管控。
為進一步確保流通於大台北地區之蔬果安全及品質無慮，臺北市市場處要求臺北農產公司持續精進檢驗設備及技術，該公司於去(110)年12月再增設第三部質譜儀，檢驗件數可自每年約1萬5千件提升至2萬件，大幅提高蔬果農藥殘留檢驗的量能。111年9月共計抽驗1,230件蔬果產品，檢驗結果66件不符合規定，銷毀重量計12,327公斤，不合格率5.3%，其中主要品項為芥藍芽、辣椒及油菜，經臺北農產公司追查產品來源，供應人主要來自雲林縣及南投縣。
臺北市市場處表示，蔬果農藥殘留應由產地源頭即開始管控，全臺產地於採收前即應由在地農政單位先行抽驗，至集貨場所仍應由在地農會及合作社場進行自主管控，臺北市市場處已要求臺北農產公司積極宣導產地農友於產地自主檢驗後，再送本市果菜批發市場交易，本市果菜批發市場在批發交易之前必須先抽檢，若有殘留農藥含量不符合則禁止交易，防止流入學校、團膳及市場；後端則由衛生局負責抽檢已進入市場各通路食材，從源頭與通路雙層抽檢，嚴格把關食安每個環節，臺北市衛生局、市場處及臺北農產公司共同努力為本市消費大眾食安把關。